Ratu Elizabeth menemui dua pupunya Putera Philip, Duke Edinburgh ketika baginda berusia 13 tahun. Mereka berkahwin pada 20 November 1947. Dahulunya perkahwinan mereka menimbulkan kontroversi, kerana Philip merupakan seorang penganut Ortodoks Greek, dan kakandanya mengahwini penyokong Nazi.

Pada 14 November 1948, Ratu Elizabeth dikurniakan anakanda pertama baginda, Charles. Mereka mempunyai empat anak:

1. Putera Charles, Putera Wales (diputerakan 14 November 1948)
2. Puteri Anne, Puteri Diraja (diputerakan 15 Ogos 1950)
3. Putera Andrew, Duke York (diputerakan 19 Februari 1960)
4. Putera Edward, Earl Wessex (diputerakan 10 Mac 1964)